Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms