Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3404Q9D506 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3404Q9D506 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3404Q9D506 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3404Q9D506 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3404Q9D506 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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