Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms