Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap53Q9D439 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms