Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy3Q9D394 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms