Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D2Q3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms