Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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