Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TbcbQ9D1E6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms