Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms