Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syf2Q9D198 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms