Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd3Q9D176 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms