Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms