Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ndc80Q9D0F1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndc80Q9D0F1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndc80Q9D0F1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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