Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms