Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zcchc8Q9CYA6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms