Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms