Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd4Q9CWX4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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