Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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