Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fcf1Q9CTH6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fcf1Q9CTH6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fcf1Q9CTH6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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