Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snw1Q9CSN1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms