Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Filip1Q9CS72 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms