Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctrb1Q9CR35 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ctrb1Q9CR35 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ctrb1Q9CR35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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