Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl35Q9CQL6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl35Q9CQL6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl35Q9CQL6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl35Q9CQL6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Mrpl35Q9CQL6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl35Q9CQL6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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