Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdm1Q9CQK3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rdm1Q9CQK3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Rdm1Q9CQK3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Rdm1Q9CQK3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdm1Q9CQK3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Rdm1Q9CQK3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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