Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms