Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2a1Q99PM3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms