Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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