Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsnaxip1Q99P25 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsnaxip1Q99P25 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms