Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep41Q99NF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cep41Q99NF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms