Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms