Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms