Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel1Q99MW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms