Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms