Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms