Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme5Q99MH5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms