Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cstf3Q99LI7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cstf3Q99LI7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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