Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms