Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms