Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms