Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms