Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spdl1Q923A2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spdl1Q923A2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms