Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms