Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi2Q920Q6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms