Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atpaf2Q91YY4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atpaf2Q91YY4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms