Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prb1Q91X93 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms