Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms