Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx9Q91VH2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms