Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApofQ91V80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApofQ91V80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApofQ91V80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApofQ91V80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApofQ91V80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms