Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc2Q8VI47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc2Q8VI47 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms