Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgdsQ8VDR7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TgdsQ8VDR7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms